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总有机碳(TOC)是以碳计算的制药用水中存在的有机物数量的间接指标。有机物是从原水、纯化及分配系统的材料以及制水系统中形成的生物膜带到水中的。T O C 测定也可用于包括纯化及分配系统在内的单元操作的质量控制。TOC 测定是将水样中的有机物完全氧化成二氧化碳，然后测定所得到的二氧化碳并以碳的浓度表示。在测定 TOC 时，必须将原先存在于水样中的无机碳如溶解的二氧化碳和碳酸氢盐与有机分子氧化生成的二氧化碳加以区别。常用的方法有两种，一种是从测得的总碳 (TC)中减去测得的无机碳 (IC)  ：TOC  =  TC － IC，另一种是在测定之前先清除样品中的 IC，但这一步也会清除掉一些有机分子，不过这些分子可以重新捕捉到，然后氧化成二氧化碳并以可清除的有机碳 (POC)进行定量。样品中剩下的有机物也被氧化成二氧化碳并以不可清除的有机碳 (N P O C)进行定量。在这一方法中，T O C 是POC 和 NPOC 的和：TOC   = POC  + NPOC 。在制药用水中，P O C 的量很少，可以忽略不计，因此，就本法的目的来说，N P O C 等价于 T O C 。