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三项研究揭示控制基因转录机制

来宝网 2012/8/13点击1142次

如今,来自美国西北大学物理科学肿瘤学中心(Physical Sciences-Oncology Center, PS-OC)的研究人员的三项开创性研究报道了他们在方法上取得的重要进步,这将使得人们更好地理解在正常细胞和癌细胞中,基因表达是如何受到调控的,同时也可能导致人们开发出更加有效的治疗试剂来治疗癌症病人。这三篇论文最近分别在Nature GeneticsNature BiotechnologyNature期刊上,可能有助于揭示控制基因转录的机制。

根据2006年发表在Nature期刊上一篇论文,通信作者 Jonathan Widom和Eran Segal 描述了一种绘制核小体的新方法。越来越清楚的是,在人体内,负责DNA组装成染色质的细胞装置发生突变是肿瘤产生的主要推动力。染色质是由DNA和蛋白组成的复合物,当遭受压缩时会形成染色体。这项研究允许人们阐述在细胞中染色质组装机制,从而有助于理解在癌症中是什么发生偏差和如何修复这种偏差。

DNA第一密码就是DNA遗传密码,能够确定细胞蛋白的组成。2006年前,Widom和Segal就已在这篇论文中报道,他们发现第二种DNA密码能够解释DNA环绕着组蛋白复合物形成的线轴样结构--核小体--的布局。

根据2012年5月27日在线发表在Nature Genetics期刊上的一篇论文和2012年5月20日在线发表在Nature Biotechnology期刊上的另一篇论文,Segal研究小组开发出出一种优雅的实验系统:它能够允许他们准确地测量不利于核小体形成的DNA序列对转录调节的影响。这项新研究使得他们能够以一种规划好的和系统性的方式,同时导入上万个DNA序列区域到上万个活细胞之中---每个细胞导入一个DNA区域---,而且能够在一次实验中非常精准地和测量每个这样的变化产生的结果。利用这种系统,Segal研究小组证实促进核小体形成的DNA序列确实对转录产生显著性负面的影响。<<<相关论文参见:“Manipulating nucleosome disfavoring sequences allows fine-tune regulation of gene expression in yeast”  和“Inferring gene regulatory logic from high-throughput measurements of thousands of systematically designed promoters”。

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