罗氏与派玛迪格携手助您全面提升二代测序建库自动化
来宝网 2015/12/7点击1936次
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高通量测序技术，又称第二代测序技术（Next Generation
Sequencing），使科学家可在一次实验中对多个样本进行多个基因的测序，并已成为现今遗传基因研究领域中主流的实验手段，对DNA和RNA样本提供一个强大的检测工具。在过去几年，NGS技术不断发展和改进以增加通量和降低成本。试剂厂家罗氏NimbleGen研发了SeqCapEZ目标序列捕获试剂系列，它可以集中丰富人类核酸内的所有外显子组或特定的基因片段，以减省分析数据时间和提高实验效率。然而，这种目标序列捕获和富集的手段往往需要大量秏时和费劲的样本建库预备，一般来说需要一位经验丰富的技术人员花上最少4天去完成48个样本建库。由于二代测序对样本有很高的要求，建库过程中需要有经验技术员高度专注去操作，包括建库过程中样本和试剂温度的控制，孵育时间等等，稍有差池也会影响测序给果。 |
| 由于二代测序的样本前处理和建库的步骤繁复，很多实验室想把这过程自动化，以确保准确性和实验成功率。有见及此，NGS试剂厂家罗氏NimbelGen与法国移液工作站厂家PrimaDiag（派玛迪格）共同在法国签订合作协议，在派玛迪格的ACSIA工作站平台上研发了NGSCapture系统来提供解决方案。ACSIA工作站拥有多个最新的技术，包括专利的自动磁化磁珠捕获装置、精准至0.1℃温控系统、200rpm至3,000rpm范围可调的振荡器，使它可优化所有磁珠法的实验条件。而且，ACISA的操作软件拥有专利的智能枪头管理功能（Smart Tip），可自动计算枪头使用数量和在没有交叉感染的情况下重用枪头，减省实验成本。为了防止实验受到外来的污染，ACSIA更可配备保护罩、紫外光灯和空气过滤系统，提供全面的保护。ACSIA工作站 |
经过优化后，ACSIA工作站很完美地利用罗氏SeqCapEZ捕获建库试剂把整个二代测序的建库过程自动化，与人手相比，ACSIA自动化平台省却了4小时的建库时间，而且，在Smart Tip的功能下，所使用的枪头比人手少了3倍，由原来的9盒枪头减至3盒。在二代测序结果方面，ACSIA比人手操作带来更稳定和更好的测序效果！（见下图） |
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二代测序检测中，ACSIA（蓝色）和人手（红色）预备样本中的18个基因组检测覆盖深度 |
ACSIA多功能工作站是全面的开放式平台，系统已内置对各大试剂盒的优化程序，如Illumina、Roche、Aligent、Kapa
Biosystems，等。除了二代测序样本制备外，ACSIA还可能进行移液分液、核酸提取及纯化、PCR样品制备、质谱样本前处理、单针挑样等实验，实在是一台多功能的自动化平台！ |
| 派玛迪格与罗氏合作新闻原稿：PARTNERSHIP WITH ROCHE DIAGNOSTICS FRANCE |
| 更多参考信息：罗氏牵手派玛迪格移液工作站进军二代测序平台 |
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