来宝网 2011/8/18点击1634次
上海交通大学医学院附属瑞金医院上海市内分泌代谢病研究所、上海血液学研究所、医学基因组学国家重点实验室的宋怀东研究员、陈家伦、宁光、陈赛娟教授等和国家人类基因组南方研究中心省部共建疾病与健康重点实验室黄薇研究员、褚迅博士等精诚合作,利用多年积累的疾病相关样本,采用全基因组关联分析(GWAS)等最先进的基因组技术,在甲亢病(毒性弥漫性甲状腺肿伴甲亢)的研究中获得突破性进展。8月15日,该研究成果在《自然-遗传学Nature Genetics》杂志上发表。(http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.898.html#corres-auth)
Graves病(Graves’Disease,GD以下简称甲亢),是一种常见的器官特异性自身免疫性疾病,其突出特征是血清中存在甲状腺刺激激素受体抗体(TRAb)。我国人群甲亢患病率约为1%,估计患者约有1300万,但目前来说,甲亢的治疗效果并不理想,其所引起的心衰、甲状腺危象等,常危及患者生命,致疾病预后不良。应用抗甲状腺药物(ATD)治疗该病已近50年历史,至今仍是一种最为安全有效的疗法。然而,相当一部分患者治疗缓解后仍有复发,复发时病情加重,且疗效不佳。对于该病在治疗中存在的困难,迫切需要分子标志物的鉴定和应用。
研究组采用GWAS技术,通过对大样本甲亢人群和正常人群全基因位点的比较、分析和验证。对1536名甲亢病患者,以及1516名未患该病的对照个体进行了全基因组关联分析。随后的研究中对第二组7504名受试者(其中包括3994名甲亢病患者,以及3510名对照个体)进行一系列相关的SNPs 检测,他们鉴定出了6个与甲亢病相关联的风险位点,发现了两个新的甲亢易感位点,由此识别了两个相关基因,其中一个是以前尚未报道过的,研究小组将它命名为GDCG4p14。研究人员发现这两个基因会影响调节免疫的T细胞功能,因此,这两个基因可能是新认识到的甲亢致病易感基因。
更有意义的是,研究人员还发现,甲亢病人中可能存在两种不同的发病机制。甲亢治疗后,TRAb持续阳性,是停药后复发的一个重要的预测指标。研究发现,对于经过药物治疗后,甲状腺刺激激素受体基因的多态性和TRAb抗体转阴性的病人不相关,但和持续阳性的病人密切相关。由此可见,该研究为临床治疗提供了一种有价值的手段,可以更为准确的区分两类病人,并有助于指导甲亢的临床用药,为病人的愈后提供有效预判。这一成果,既是GWAS技术在推进疾病基因组研究和药物基因组研究方面的一个重要的成果,也是通过基因组研究,推动临床研究和基础研究的结合,加快临床医疗技术提高的典型事例。
这项研究针对多个基因进行了多中心、大样本和反复的验证。需要分析大量样本,研究团队在考虑时间及成本及数据质量等多种因素后,使用了Fluidigm BioMark高通量基因分析系统 进行SNP 实验认证。 Fluidigm BioMark高通量基因分析系统能够同时对最多96 个样品进行多达96 个位点的SNP分析,使研究人员能迅速获得目的基因的更多信息,满足了GWAS高灵敏度,高内涵,大动态范围和超高通量的应用需求。
该研究团队是Fluidigm BioMark高通量基因分析系统在中国大陆最早的使用者之一,这篇文章也是Fluidigm BioMark众多高水平文章中第一篇主要由中国内地学者发表的研究报告,相信随着该系统的普及,将有更多高水平文章的产生。
该研究得到了国家高技术研究发展计划(863计划)、国家自然科学基金、上海市科委重点项目和上海市教委重点学科等基金的支持。