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NGS文库自动化构建实例
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2016/7/29
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空白
在二代测序中,基因文库的构建是一项十分耗时耗力的工作,需要熟练的科研技术人员在整个操作过程中保持需高度注意力,花费大量时间和精力才能完成建库工作。因此,大多数实验室有将文库构建工作自动化的需求,以节省人力。
空白
应文库构建自动化的需求,派玛.迪格
(PrimaDiag)
公司研发了
ACSIA NGS
LibPrep
自动建库平台,该平台移液精准,重复性高,使用了创新专利技术
APIM
(感应磁化吸引技术)处理磁珠,根据需求通电或断电产生磁力和去磁化,温度控制精准到
0.1
℃
,震荡速度
200 - 3000 rpm
范围可调。
空白
归功于
ACSIA
平台的灵活性,派玛.迪格公司的科研人员将
NEBNext Ultra DNA kit
的文库构建操作步骤在
ACSIA
文库构建平台上实现了全自动化。派玛.迪格公司将提供优化好的预设程序,中途不需要人工干预,一次实现
96
个文库的全自动化构建。
3
小时的人手建库工作,使用自动化平台,只需人手操作
10
分钟。
空白
经过优化的操作步骤允许使用最少的枪头数来完成整个建库工作,大大节约试剂和耗材成本。例如构建
48
个
DNA
文库仅需要3盒枪头,而人工操作使用的枪头数会达到14盒之多。
比较
ACSIA
全自动化和人工建立的文库,
DNA
片段大小分别是
338 bp
和
340 bp
,十分相近,见图
1
,而使用
ACSIA
建库得到文库质量比人工建库高将近
30%
,见图
2
。
空白
减少人手操作时间,极大的节省枪头成本,文库得率显着增加,使得
NEBNextUltra DNA kit
在
ACSIA NGS
LibPrep
自动文库构建平台上完美实现全自动化建库。
图
1
:自动化和人工建库得到的
DNA
片段大小接近
图
2
:自动化和人工建库的到的平均质量
分别是
1864 ng
和
1284 ng
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